Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRKQ15262 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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