Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms