Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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COL4A6Q14031 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL4A6Q14031 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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