Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ITGA9Q13797 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA9Q13797 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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