Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ATP1A4Q13733 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ATP1A4Q13733 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ATP1A4Q13733 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ATP1A4Q13733 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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