Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM28Q13263 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM28Q13263 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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