Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms