Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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TMEM115Q12893 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM115Q12893 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms