Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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