Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms