Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TFF3Q07654 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TFF3Q07654 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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