Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSPL2Q05D32 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms