Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms