Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCNT1Q02742 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms