Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SAR1B-202ENST00000439578 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RGN-201ENST00000336169 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PSMD10P1-201ENST00000436861 681 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC112236.1-201ENST00000561977 1098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms