Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RELBQ01201 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RELBQ01201 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RELBQ01201 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms