Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms