Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms