Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms