Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIK1P39086 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK1P39086 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms