Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms