Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PTPRMP28827 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRMP28827 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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