Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRAP18433 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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