Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-EP13747 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms