Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms