Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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