Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RAB23Q9ULC3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RAB23Q9ULC3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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