Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX15Q9NRS6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms