Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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