Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM4Q9BWF3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms