Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HDAC11Q96DB2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HDAC11Q96DB2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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HDAC11Q96DB2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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