Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms