Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MYRIPQ8NFW9 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYRIPQ8NFW9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms