Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PIK3C3Q8NEB9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PIK3C3Q8NEB9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PIK3C3Q8NEB9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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