Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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