Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms