Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF182Q8N6D2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF182Q8N6D2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms