Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms