Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC18A3Q16572 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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