Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SCN9AQ15858 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SCN9AQ15858 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SCN9AQ15858 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SCN9AQ15858 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN9AQ15858 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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