Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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