Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CHD4Q14839 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CHD4Q14839 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CHD4Q14839 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD4Q14839 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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