Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms