Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms