Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3B2Q13367 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms