Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF1Q13077 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF1Q13077 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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