Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms