Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms