Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSRP1Q08945 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms