Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms